8月27日（根据第四卷内容推测）
日本·神奈川县某海边
上条和茵蒂克丝以及上条的双亲入住海边旅馆「海神」，上条的表妹龙神乙姬半夜才入住。
魔法「天使坠落」发动。
8月28日
早上——
上条起床后发现旅馆内除自己和父亲外，所有人的样貌都改变了。
英国清教『必要之恶教会』的魔法师神裂火织和土御门元春出现，并向上条说明现状。
晚上八点——
上条带着神裂去见自己的家人，并在无意间撞见沐浴中的神裂。
逃狱犯火野神作从地板下出现并袭击上条，俄罗斯成教的魔法师「米夏·克洛伊洁芙」乱入并击退了火野神作。
8月29日
早上——
上条从新闻中发现火野躲在了自己的老家。
上条、神裂、土御门、「米夏·克洛伊洁芙」四人赶到上条老家，将火野神作击倒。
上条从土御门的推论中得知启动「天使坠落」魔法的犯人居然是自己的父亲上条刀夜，「米夏·克洛伊洁芙」于是先一步赶去排除犯人。
傍晚——
赶回旅馆的上条见到自己的父亲，「米夏·克洛伊洁芙」出现并现出真面目·大天使「神之力」。
神裂赶来牵制大天使的攻击，上条带着父亲回旅馆避难。
在旅馆内出现的土御门将上条和刀夜击倒，随后使用魔法「赤术式」将上条老家（仪式现场）轰掉，因体内的排斥反应晕倒。
魔法「天使坠落」解除，大天使「神之力」回到上界，真名为莎夏·克洛伊洁芙的俄罗斯成教修女重新取回身体。
8月30日
茵蒂克丝邮购的预言书《马拉奇的预言》送到了上条宿舍。
8月31日（暑假最终日）
凌晨——下午
半夜购物回家的一方通行将找他求助的妹妹（20001号）—最后之作带往自己的住所休息。
上条半夜醒来，在茵蒂克丝撕咬中发现自己的暑假作业完全没做，不幸的一天开始。
从宿舍中外出的御坂美琴遇见常盘台中学理事长之孙——「海原光贵」。为了甩开烦人的海原，美琴抓住路过的上条当麻充当伪恋人。
真正的海原光贵出现在美琴面前，而伪装成「海原光贵」的阿兹特克魔法师开始袭击身旁的上条当麻。
两人追逐至某工地战斗时，「海原光贵」被倒塌的钢骨压住。
「海原光贵」要求上条答应他的一个「约定」被躲在墙角的美琴听到。（魔法师最后被上条交由土御门处理）
睡醒之后的一方通行将最后之作带往餐厅吃饭，发现参与「绝对能力进化实验」研究员天井亚雄在餐厅周围徘徊。
一方通行吃完饭后将最后之作独自留在了餐厅，自己则前往「绝对能力进化实验所」。
神道教魔法师暗咲逢魔强行侵入学院都市。
下午——晚上
到达研究所的一方通行从研究员芳川桔梗处了解到最后之作的特殊性以及研究员天井亚雄最近的不稳定动向，于是决定回餐厅找最后之作。
上条带着茵蒂克丝去餐厅吃饭，冲进来的暗咲逢魔将茵蒂克丝掳走，上条开始到处追寻他们。
一方通行回到餐厅，得知最后之作被天井亚雄带走,前往「超能力者“超电磁炮”量产型开发计划的研究所」。
在「超能力者“超电磁炮”量产型开发计划的研究所」门口，一方通行将最后之作脑中的所有电子病毒清除，但同时被天井亚雄射成重伤。
暗咲逢魔布置出「神乐舞台」，企图从茵蒂克丝脑中获取魔导书《抱朴子》的知识。
从研究所及时赶来的芳川桔梗将最后之作收容到培养器中，与天井亚雄互相对射至昏迷。
上条在大厦楼顶上发现受到魔导书侵蚀暗咲逢魔以及被绑住的茵蒂克丝，在得知暗咲掳人的动机后，上条决定帮助他解除他心仪女性的诅咒，两人在半夜从学院都市冲出去
9月1日（开学式）
凌晨——
在医院中苏醒的芳川桔梗从「冥土追魂」处了解到一方通行和最后之作无生命危险，不过一方通行却必须依靠「御坂网络」的补助演算才能维持身体活动以及能力的使用。
从外部助人归来的上条当麻在暗咲逢魔再度协助下，又从外面冲回了学院都市。
上午——
超电磁炮40话
新学期的婚后光子在学校内结识了湾内绢保和泡浮万彬，同时见识到了常盘台中学最大派阀“食蜂派阀”的气势后决心组建起自己的派阀。
土御门被带到亚雷斯塔的面前，向他通报同属英国清教的魔法师雪莉·克伦威尔侵入学院都市，但因为向亚雷斯塔提出由他来对付雪莉的建议遭到亚雷斯塔的反对，被困在无门窗的大楼内。
经过半宿才回家的上条赶到学校参加开学式。
小萌老师在介绍新的转校生（姬神秋纱）时，茵蒂克丝在此时乱入到上条的班级，不过很快就被小萌老师赶了出去。
无所事事的茵蒂克丝在学校的食堂里与自称转校生的风斩冰华成为朋友，不久之后就在更衣室与上条见面。
上条决定带着风斩和茵蒂克丝去地下街游玩。听到姬神秋纱关于风斩冰华的传闻。
侵入都市的雪莉·克伦威尔与赶来阻挡的白井黑子交战，白井在战斗中被雪莉召唤的石巨人艾利丝所困，最后得到了美琴的救援，雪莉趁乱逃走。
下午
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