没过几日，朝廷的上谕便即快马南下，送到了阮元的抚院之中。依嘉庆最后决议，准浙江加造大船三十艘，铸新炮四百门，但由于川楚白莲教之战尚未结束，户部暂时不予拨款，准阮元自用浙江藩库，其余款项，亦许自筹。
阮元向嘉庆上疏之后，很快就回到了杭州，与王昶、孙星衍等人一同商议保甲、接济之事，经半月之力，定下《缉匪章程》七则，那七条分别是：
一、沿海口岸村庄山岙，尽行保甲。
二、海边渔捕各船，严查奸弊。
三、沿海营县严查偷漏米铁。
四、沿海营县严查偷漏火药。
五、各口商船当艇匪来时，勿贪利独行。
六、沿海营汛严查通盗销赃奸民。
七、沿海村岙壮丁进行团练，策应官军。
此外，如王昶议，定保甲条例，十丁立一甲，十甲立一总甲，一村立一总保，一山一岙立一岙长。到得二月，以上条例商议已定，便即下发各道府县，令其严于遵行。也就在这时，嘉庆的上谕经快马传递，已到了杭州。
看着这封看似温言劝勉，实则几无帮助的上谕，阮元也只得再次请来了孙星衍和王昶，叹道：“虽说皇上那边，已经同意了加铸炮械，兴修战船之事，可按这上谕所言，竟是一两现银都没有拨给我们。只是说藩库存银，可以自用，可如今藩库余银，却还有多少呢？渊如兄，你和刘藩台关系也算不错，这件事可有听闻？”
“藩库余银确是不少，可若是去掉那些必须的开支，还能剩下的就不多了。”孙星衍道：“这几日，我也和刘大人商议了一些赔补亏空之事，想着藩库余银若是充足，或许可以补上一二。可眼下依前两年的旧例，浙江藩库今年还要再拨出六十万两银子，用以川楚军需之用，此外还要把各项公费的用度留下，不能另作他用，这样一来，所存余银也只有两三万两之数了。伯元，这样算下来，藩库最多也只能提出两万两银子用作船炮之需。可三十艘大船，四百门大炮，这需要多少银子啊？按咱们之前的预计，这些船少说要八万两，四百门炮嘛……没有两万两也是办不下来的。这八万两的缺口，却上哪里去补啊？我和刘藩台商议之时，所余公费，已是必不可少的开支，藩库那边，能省下的，都已经省下了。”
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