万历皇帝赞道：“首辅老成持重，深谋远虑，堪称辅国良臣。内阁责任重大，协调百官政务，正值元月当立新政，朕问你你对此有何准备？”
王锡爵奏道：“臣有定国论一政体疏请皇上御览，臣近来所听言之弊，往往不问其所言之事，而先揣其所言之心，因此朝廷中常因此争论分嚣，上下抵触，长此以往政事也将荒怠。臣以为皇上应首先锐意思治，勤政宽仁，与朝臣合舟共济。其次臣请加强内阁中枢之权，以便疏通政务。”
吏部尚书孙鑨忽听王锡爵意欲加强阁权，心生敌意，出列问道：“六部各具细务，内阁审议票拟，老为何还要加强内阁之权？压制百官并非秉政之道。昔日权相张居正独断专行，内阁权力之大为立国以来所未有，阁老莫非想效仿张居正么？”
王锡爵答道：“大司徒你有所误解，十年以来看似各尽其职，但实则朝臣之间猜忌不断，闻风弹劾，若坐视不理必将形成各府衙互相掣肘，朝中明争暗斗之局，地方政务也将散乱。所幸皇上天纵英明，我等臣子尚未迷失于名利之争，国事仍大有可为。张居正虽擅权专断，但至万历十年，国库充盈，四海升平，吏治也颇有改观。而近年来朝臣争斗，国事时有松懈，我等不可学张居正之弊，也不可忘张居正之功。内阁、各部府衙应再细分权责界限，事事当有核查再行上报，内阁调停各部，若内阁有失自可请皇上圣断，以借此使朝臣能协调共事，尽责本职，上行下效，督导地方。进而便可整肃吏治，肃清政风，想必这也是诸位之心愿，我等也能全力为皇上分忧，天下大治，再迎盛世。”
顾宪成则认定王锡爵是为独断专行而欲盖弥彰，便出言问道：“请问阁老，自成祖设立内阁之后，百余年来阁权只增未减，乃至形成阁权独大之势，自古相权过大必危害社稷，阁权有如相权不可不制。太祖废丞相而权分六部，继而成祖加设内阁，便是为相互督导。万历十年以来，阁权不再强压各部，也正因此才使臣子之间得以尽职尽责，各抒己见，忠孝为本，尽心国事。朝廷官员皆守法明理又怎会遭致弹劾？又怎会难迎盛世？若阁老执意加强内阁权力只怕后世难以制衡阁权终将引发权臣当国之事。”
王锡爵答道：“我并非执意加强内阁权力，若皇上不许予以驳回即可。阁权所为应自有律法明文规定，朝臣监督兼以圣断。若再有奸佞权相也是时势成因，不可以偏概全。其次加强阁权除我方才所说之利外亦可遏制后妃、外戚、宦官干政。阁部引领百官辅佐皇上，再有皇上引领百官监察阁部，领国之权无论如何扩大也实不在阁部之手而在皇上。臣等不过是为君臣共治，永保大明江山社稷而竭尽所能，请顾部郎不必多虑，也请诸位同僚共证此誓。”群臣一时也多有私语但也未再发问。万历皇帝准奏，令内阁六部详拟方案。随后万历皇帝细听各部政务，一一答复，按时散朝。
当日夜万历皇帝密召王锡爵进宫相见，万历皇帝拉住王锡爵手道：“天还尚未转暖，阁老保重身体才是。”王锡爵也惊请皇帝保重龙体，万历命人搬来暖凳给王锡爵坐下，并请王锡爵品尝御膳房最新制作的糕点，王锡爵受宠若惊。万历皇帝道：“朕常想起阁老之前在朝之时，公正无私，忠君明礼，即便纠正朕误也总能说到朕的的心里。朕很久都没有这样的感觉。”
王锡爵谢道：“皇上过誉，臣只是尽做臣子的本份，臣只知一心一意辅佐皇上治理天下，实现皇上的治国理念，不负历代先祖。”万历道：“如此甚好，朕正是要这本份，太多的大臣只会借着忠诚的名义去为自己争名夺利，甚至肆意欺辱朕的器量，一旦涉及国家大事便尽显昏庸无能！”
王锡爵立刻伏地劝道：“皇上不可如此辱骂臣子，依臣看来，不少官员是政才平平，但论忠心必是誓死报效之人，只需善加协调，量才而用，循序渐进也都不失为精干之员。请皇上息怒，保重龙体。”
万历皇帝看向王锡爵，心中起意，急忙扶起：“阁老你这是做什么，快起来，入座。朕不过是一时之念而已。此前朕曾答应百官于今年春举行太子册立大典。依阁老之见此时举行册立合适与否？”王锡爵不知何意，稍作犹豫便请万历自可做主。
万历皇帝道：“朕总还是犹豫，这太子之位关乎国本，群臣如此关心也是情理之中，朕深知此理。因此朕也时刻慎重考虑此事。中宫尚未生子，朕也值龙体少壮，现在立太子是否为时尚早？朕曾想待中宫生下嫡子自然将为太子之选。但若中宫不能生育岂不耽误大事。为此朕欲考察皇子，择贤而立，先行将皇长子、皇三子、皇四子并封三王，
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