杨涟，左光斗，魏大中等东林党人被逮捕，他们的罪名是受贿，而行贿者是早已经被处决的熊廷弼。受贿的证据是已经被谋杀栽赃陷害的另一位东林党人汪文言的口供，在这无耻的文书里，杨涟被认定受贿两万两，左光斗等东林党人人人有份。
审讯开始了，作为主要的对象，杨涟首先被提审。
许显纯首先拿出了那份伪造的证词，问道“熊廷弼是如何行贿的？”
熊廷弼是一位因为辽东战事而被牵连进来的一名武将。
许显纯告杨涟，说杨涟收受了熊廷弼的贿赂，意图将熊廷弼救出监狱。
“辽阳失陷前，我就曾上书弹劾此人，他战败后，我怎会帮他出狱？文书尚在，可以对质。”
许锦衣卫背地里耍阴招很有水平，既然无法胡扯下去，就用刑具说话吧。
“用刑！”
“用什么刑，有死而已。”
许显纯的确想让他死，但是让一个顾命大臣死，必须找到合适的罪名。
拷打如期举行，拷打规律是每五天一次，打到不能打为止，杨涟的下颌脱落，牙齿打掉，却依旧无一字供词。然骂不绝口，死不低头。
再一次严酷的拷打之后，杨涟回到监房，写下了【告岳武穆疏】，在这封文书里杨涟没有无助的抱怨，也没有愤怒的咒骂，只说道“此行定知不测，自受已是甘心。”
“涟一身一家气何足道，而国家大体大势所伤实多。”
这句话很好理解，意思就是说，“我的家怎么样，我怎么样都不需要挂在口头上说，都没有关系，可怜的是在这个年代，我的国家的国力已经大不如从前，受伤很多了。”杨涟临死前依旧没有为自己遭遇到的不平愤恨，却依旧心系国家，担心黎明百姓的死活，一个官员能够忠诚到这个地步，冤枉到如此地步，也真的是世所罕见。
昏暗的牢房里，惨无人道的迫害，无法形容的痛苦，死亡边缘的挣扎，却没有仇恨，愤懑，只有坦然，从容。
在无数次尝试失败之后，许显纯认识到让杨涟低头认罪是不可能的，栽赃不管用，就暗杀吧。
魏忠贤清楚，杨涟是极为可怕的对手，是绝对不能放走的，许显纯接到命令，他信心十足地向老上司表示“一定不辱使命。”然后，他说不辱杀一个忠臣的使命。
杨涟面对着自己的命运，写下过两千字的遗书，交给过同批次入狱的东林党人顾大章，杨涟被杀，顾大章也在劫难逃，可是，一名狱卒却发现了这封信，他在历史的长河里已经失去了名字，身份和家庭背景的信息，但是，却有这么一个人在，他清楚这一切都是栽赃陷害，他清楚被谋杀的都是忠臣，所以，他没有高发这封绝笔信，反而是把信件藏了起来，等魏忠贤失去势力之后，狱卒将绝笔从关帝庙的背后取出，公之于众。
1625年7月，许显纯对杨涟进行了谋杀，因为要制造用刑逼供，然后杨涟身子太薄弱，一不小心没撑住，然后死了的假象，不能被别人发现是故意杀害，所以，许显纯想了很多谋杀的办法，最后用铜锤砸杨涟的胸膛，几乎砸断了杨涟所有的肋骨，并且使用布袋压身，甚至将铁钉钉入了杨涟的耳朵。
杨涟的身体很好，即使许显纯用了所有想的出来的酷刑，杨涟都没有死，但是，许显纯想出了新招，在铁钉被钉入杨涟的脑袋之后，杨涟身亡，年仅五十四岁。
“仁义一生，死于诏狱，难言不得死所，何憾于天，何怨于人，唯我身副宪臣，曾受顾命，孔子云：托孤寄命，临大节而不可夺，持此一念可见先帝于在天，对二祖十宗于皇天后土，天下万世矣！大笑大笑还大笑，刀砍东风，与我何有哉！”
“涟即身无完骨，尸供俎蚁，原所甘心，但愿国家强固，圣德明，海内长享太平之福，此痴愚念头，至死不改。”
在此次魏忠贤对所有反对派的打杀之中，朝廷中一共有六位臣子死去，共“杨涟，左光斗，魏大中，袁化中，周朝瑞，顾大章。”史称“六君子之狱。”
但是魏忠贤似乎觉得杀人杀得不够痛快，即然开杀了，就一路杀到底吧，把那些曾经有一两句话得罪过他的，曾经见了他不弯腰不鞠躬，或者在他穷困潦倒的时候污蔑过他，嘲笑过他的，他统领军队，在朝廷中执政的时候不乖乖听话的都揪出来了，魏忠贤的手伸得越来越宽，越来越广，越来越长，于是，不再限于朝中的执政大臣，所有男二号，男三号，男四号都被魏忠贤搬了出来。
在六君子之狱之后，魏忠贤以及他的同伙又杀了很多人，其中又有“七君子之狱”。
七君子之狱中被杀害的人有“高攀龙，李应升，黄尊素，周宗建，谬昌期，周起元，周顺昌。”
在一系列杀人和被杀的行动中，朝廷被弄得乌烟瘴气，皇帝却丝毫没有感觉，该吃饭吃饭，该睡觉睡觉，然而，就在他听歌唱曲，和宠妃软语温存的时候，在离他居住的宫殿不远的地方却是惨绝人寰的酷刑，和悲愤犹如黄河水的临终人群。
皇帝能做到这个地步也是无法吐槽了，如果没有崇祯皇帝出手，也许魏忠贤在杀完所有看不顺眼的人之后总有一天看着皇帝，哎，这皇帝看着也不太顺眼，也会把天启皇帝朱由校给顺便也给杀了的，可惜的是，魏忠贤还没有动这个念头，天启皇帝朱由校就已经身体不舒服，病危了。
1627年八月，朱由校在皇位上玩了七年
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