神武四年，公元1802年，2月，李定下旨集合南海和北海舰队组成联合舰队，配合东南军区收复台湾。联合舰队包括两艘镇远级，两艘宁远级，七艘镇海级，十二艘定海级和三百五十余艘小型船只。舰队于2月8日从厦门出发，护送运兵船到澎湖群岛。再舰队炮舰的掩护下东南军区士兵，经过半天的奋战占领了澎湖岛。接着便依次澎湖列岛的其他岛屿，然后经澎湖水道直扑台湾府（今台南）。联合舰队于台湾府正西100公里处，遇到了蔡牵的船队，双方展开了激烈的厮杀。蔡牵船队中最大的一艘战舰，便是从吕宋购买的那艘800吨排水量的战舰，其他的都是500吨以下排水量的小船，总体来说联合舰队占据了绝对的优势。而且李定的舰船上，除了300吨排水量以下的，都装配有火炮。因此这次澎湖水道的大海战，几乎是一边倒的战争。蔡牵的船队几乎被全歼，其中那艘800吨级的战舰和四十余艘小型战舰被俘虏，十数艘小战舰趁机逃走，其余都被击沉。2月12日，联合战舰护送东南军区两万部队在台湾府西北的安平登陆，然后返航。李志忠指挥军队围困台湾府，虽然蔡牵顽强抵抗，但是李志忠在装备了150余门大炮，10000条火枪的情况下，如果还不能攻克武器落后的台湾府，那他就真对不起自己上将军的军衔了。况且李志忠还想凭借此次的战功，在晋升一级军衔。李志忠于3月5号攻克台湾府，蔡牵在他的大流球王府中和他的妃子们**而死。南下攻克凤山后李志忠率军一路北上，先后攻克嘉义、鹿港、彰化、台中、新竹、淡水和鸡笼，到达台湾最北端后，便沿着台湾东海岸南下攻克噶玛兰厅（今宜兰）。知道5月中旬，李志忠基本平定了台湾岛，他也终于如愿被晋升为大将军，东南军区司令的头衔也去掉了暂署的前缀。东海舰队总司令沈书恒晋大将军衔，南海舰队总司令李长庚晋大将军衔，李志诚南海舰队副司令之职由暂署改为正式。其后，李定下令改台湾府为台南府，改鸡笼府为基隆府，改淡水为台北府，台湾省首府由台南迁往台北，基隆和凤山两港设为军港，分别为东海舰队和南海舰队所用。东南海面的战事结束后，李定下旨东南沿海无地百姓可以迁往台湾垦荒，所开垦的耕地两年免税，并归开垦者所有。李定还命令北海、东海和南海三只舰队四处寻找岛屿，但后立碑确定主权，标注位置之后上报朝廷，以便朝廷在以后的地图上标出。如果是沿海百姓出海发现无人岛屿，上报本地官府后可以得到赏银。其后，南海舰队在台湾东南方发现了七星屿、兰屿和绿岛。还在吕宋的北方发现了今天的巴坦群岛和巴不延群岛，并且在其中每一座岛屿上都投下了主权碑，并有上报李定由其命名。另外，南海舰队还根据李定的指示，在东沙群岛、西沙群岛、中沙群岛的每一座岛屿和岛礁上投下了主权碑，并且正在南沙群岛寻找和占领岛屿。东海舰队在台湾北方发现了今天的彭佳屿、钓鱼岛和赤尾屿，在基隆东侧发现了今天的先岛诸岛和公古列岛。在投下主权碑后，上报朝廷命名。北海舰队发现了库页岛被端的一个岛屿（今莫涅龙岛）和虾夷岛西北方的两个岛屿（今礼文岛和利尻岛），并且还穿过库页岛和虾夷之间的海峡，发现了千岛群岛。北海舰队还勘察了虾夷大岛，认为尽管日本声称此地使他们所有，但是其实是无主之地，上报了李定请求占领。李定和大臣商议以后，大臣们都不同意，无奈李定坚持并且说出了理由，最终使大臣们同意了出兵占领虾夷。1802年10月，北海舰队出兵虾夷，由于此时的虾夷还没有统一的国家，只有许多还生活在原始状态的部族，东北军区的大军很快就控制了全岛。并且攻破了虾夷南方日本人建立的几个据点，俘虏了近万日本人，李志斌根据李定的命令，判所有日本人劳改。李志斌派人照会日本幕府，称虾夷为中华帝国之固有领土，此后不得侵犯。李定改虾夷岛为北海岛，从北海省划出库页岛，北海省改称江东省，库页岛和北海岛组成一个新省份，名为海北省。库页岛和北海岛的叛乱此起彼伏，倒神武六年（公元1804年）再也没有反抗力量，这期间中华帝国的军队总共在两岛逮捕和杀害将近一百二十万人，几乎没绝了两岛的土著民族。当然，这种近乎残酷的方式，使得中华帝国有了大量的免费劳动力，为中华帝国的初期建设省去了大笔开支和人力。中华帝国的水泥大道，在神武十年终于串联了全国所有的省会，也包括西藏的拉萨和新疆的迪化。日本幕府自从得到中华帝国占领虾夷后，便一直寝食不安，担心中华帝国回趁机侵略日本，但一直都没有动静，便又恢复了往昔的宁静，只有国内的有识之士看出了日本的危机。1803年3月李志斌和吴耀庭率军攻克乌里雅苏台，灭亡了沙俄支持的伪蒙古国。然后两人继续北进唐努乌梁海地区，并于7月完成占领。虽然此后外蒙地区一直都会有叛乱，但无上大局并且随着水泥大道的修建，帝国在此地的统治进一步加深，便使外蒙古牢牢的于中原联系在了一起。事后，李志斌晋督帅军衔，仍担任东北军区总司令，吴耀庭则晋大将军衔，暂署蒙古军区总司令。蒙古彻底平定后，李定加快了平定新疆的步伐。1803年8月，吴显扬和李志孝西进攻克伊犁，沿着伊犁河西进攻克阿拉木图后，逐步收复被沙俄侵占的巴尔喀什湖
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