青阳县：
铜陵县：南偏西有大通巡司。
石埭县：
建德县：南偏西有永丰镇巡司。
东流县：南偏南有香口镇巡司，后迁县北吉阳镇。
宁国府：元为宁国路。龙凤三年(1357)改置宁国府，属行省；七年(1361)更名宣城府，十二年(1366)更名宣州府，
吴元年(1367)复更名宁国府。
宣城县：倚郭。北有水阳镇巡司，北偏西有黄池镇巡司。
南陵县：南偏西有峨岭巡司。
泾县：南偏东有茹蔴岭巡司。
宁国县：东南有岳山巡司驻岳山麓，洪武年间迁县境纽口，再迁县东南石口镇；西南有胡乐巡司。
旌德县：西北有三溪巡司；东北有乌岭巡司，后废。
太平县：西南有宏潭巡司，后迁县西南郭岩前。
徽州府：元为徽州路。龙凤三年(1357)改置新安府，属行省；吴元年(1367)更名徽州府。
歙县：倚郭。东南有街口镇巡司，东有王干寨巡司，西北有黄山巡司。
休宁县：西南有黄竹岭巡司，寻废；东南有太厦巡司，后迁县东南屯溪。
婺源县：元为婺源州[无倚郭]。洪武二年(1369)降为婺源县，仍属徽州府。西南有太白巡司，东有大镛岭巡司；
西偏南有项村巡司驻浇岭，后迁县西北严田，万历九年复迁浇岭。
祁门县：北偏西有大共岭巡司；西南有良禾岭巡司，后迁苦竹港。
黟县：
绩溪县：西北有濠寨巡司；又东有西寨坑巡司，后废。
徐州：元为武安州[无倚郭](初名徐州)属归德府。洪武元年(1368)复更名徐州，复徙故治，并改属开封府；四年
(1371)改属临濠府，十四年(1381)升为直隶州，直属六部。天启四年(1624)徙治云龙山。东南有吕梁洪巡
司。
萧县：万历五年(1577)自县西北徙今治。西北有赵家圈巡司。
沛县：元属济宁路(初属济州)。吴元年(1367)改属徐州。
丰县：元属济宁路。吴元年(1367)改属徐州。
砀山县：元属济宁路。吴元年(1367)改属徐州。
滁州：元属扬州路。洪武元年(1368)省倚郭清流县入州；七年(1374)改属中立府，二十二年(1389)升为直隶州，
直属中书省。西北有大枪岭巡司。
全椒县：洪武元年(1368)省入滁州，十三年(1380)复置全椒县，仍属滁州。
来安县：洪武元年(1368)省入滁州，十三年(1380)复置来安县，仍属滁州。东北有白塔镇巡司。
和州：元属庐州路。洪武元年(1368)省和州入倚郭历阳县，县直属庐州府；二年(1368)升县为和州，七年(1374)
改属中立府，二十二年(1389)升为直隶州，直属中书省。东有浮沙口巡司，南有裕溪镇巡司；南又有牛屯
河巡司，后迁县北偏东乌江镇。
含山县：洪武元年(1368)省入历阳县，十三年(1380)复置含山县，仍属和州。
乌江县：洪武元年(1368)省入历阳县为乌江镇。后迁牛屯河巡司来驻，为乌江镇巡司。
广德州：元为广德路。龙凤二年(1356)属行省，十二年(1366)改置广兴府，洪武元年(1368)倚郭广德县更名广阳县，
四年(1371)降府为广德直隶州，十三年(1380)省倚郭广阳县入州。西南有陈阳、广安巡司，东北有杭村巡
司。
建平县：北有梅渚巡司，南有陈村巡司。
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中军都督府属南直隶在外卫所：
苏州卫：吴元年(1367)置苏州卫于苏州府。
嘉兴中左千户所(在浙江)：洪武九年(1376)置嘉兴守御中左千户所于浙江省嘉兴府。
太仓卫：吴元年(1367)置太仓卫于昆山州太仓城(太仓州)。
吴淞江千户所：洪武十九年(1386)置吴淞江守御千户所于嘉定县东。
宝山千户所③：嘉靖三十六年(1557)置协守吴淞中千户所于嘉定县吴淞江千户所东南，万历五年(1577)更名宝山
守御千户所。
镇海卫：洪武十二年(1379)置镇海卫于??????海口，后徙治太仓卫城。
崇明沙千户所：洪武二十年(1387)置崇明沙守御千户所于崇明县。
金山卫：洪武二十年(1387)置金山卫于华亭县东南。
青村中前千户所：洪武二十年(1387)置青村守御中前千户所于华亭县东。
南汇嘴中后千户所：洪武二十年(1387)置南汇嘴守御中后千户所于上海县东南。
松江中千户所：洪武三十年(1397)置松江守御中千户所于松江府。
兴化千户所：洪武年间置兴化守御千户所于兴化县。
泰州千户所：洪武年间置泰州守御千户所于泰州。
通州千户所：洪武五年(1372)置通州守御千户所于通州。
镇江卫：洪武元年(1368)置镇江卫于镇江府。
扬州卫：洪武四年末(1372)置扬州卫于扬州府。
高邮卫：洪武元年(1368)置高邮守御千户所于高邮府，四年末(1372)升置高邮卫。
仪真卫：洪武八年(1375)置仪真守御千户所于仪真县，十三年(1380)升置仪真卫。
淮安卫：洪武元年(1368)置淮安卫于淮安府。
盐城千户所：洪武二十二年(1389)置盐城守御千户所于盐城县。