经过数次秘密谈判、协商。十月十八日上午，足利义昭入宫参见天皇，表达恭敬之意；下午，天皇旨意宣下，足利义昭就任室町幕府第十五任将军，同时升序从四位下，任官参议左近卫权中将。二条晴良替代被流放的近卫前久成为関白。上洛正式宣告成功。
紧接着，再次宣下，封赏振兴幕府的功臣。织田信长升序从五位下，任官弹正忠；佐久间信盛任官右卫门尉；柴田胜家任官修理亮；滝川一益任官左近将监。
得到消息的青山长虎心中微微有些羡慕，却不失望。毕竟这次任官的三个人的资历不是自己能比的，佐久间信盛和柴田胜家二人可以说是织田家拥有实权的笔头家老；滝川一益则是主公需要补偿的对象，家中重臣唯有他一个守在家中，没能上洛。
因为历代将军本処所在地，乌丸中御门第（二条城）在永禄之变时化为灰烬，一直没有修复。十九日，足利义昭从清水寺搬到三管领之一的细川家宅邸暂代御所，开始行使将军职权，首先发布了四条命令。
其一，为了政权安定着想，将偏讳‘昭’字赐予拥有管领家格的细川家（细川昭元）和畠山家（畠山昭高）以及拥有関白家格的二条家（二条昭实）。
其二，收回哥哥义辉拥有的山城国御料所，保证幕府拥有固定的收入。
其三，为了恢复幕府职能，起用足利义辉时代重臣摄津晴门为政所执事，奉行众饭尾昭连、松田藤弘为执事代，负责武家关于财政和领地的诉讼。
其四，山城国不设置守护，命令三渊藤英在伏见设置山城役所，负责山城治安及领土争端。
听到手下传来的第四条将军令，青山长虎禁不住恶从胆边生，暴怒而起。因为源七郎按照织田信长的命令负责洛西行政权，就包括属于久我区域的伏见。青山军的驻营地，就是设置在伏见。这个新任将军却连人都没有派来知会一声，就想不吭不响的造成事实，拿回这一片区域。
“这个混蛋，我辛辛苦苦的治理好了，他就过来抢桃子。真把我当成废物吗？将军了不起啊，还不是让松永久秀割了脑袋。这样净做混蛋事的将军，幕府迟早玩完。”把本阵设置在伏见一座山丘上的青山长虎，在阵屋内破口大骂。吓得菊千代等一干小姓赶紧把周围的无关人士赶了出去，并下了禁口令。
虽说算上重生前，青山长虎怎么也是大叔的年纪了。还是没有按捺下心中怒火。直接下令把整理好的户籍数、年贡纳书等文件统统收好，到时一件也不会交给那个叫三渊藤英的瘦马脸。主公下令也没用，就说失火损毁掉了。
没想到第二天没等到三渊藤英过来，倒是听到传言,足利义昭在今天准备继续发布将军令时,连挨了三个‘耳光’的消息.让源七郎大爽。
第一个耳光是被关押在清水寺的三好三人众之一石城友通，竟然在他被封为将军这日的夜里，莫名其妙的‘失踪’了。清水寺所有守卫都是由新任将军的御家人负责，显然失踪的事赖不到织田信长手下任何人。
第二个耳光是足利义昭想要封松永久秀为大和守护，命令下来之前，被筒井顺庆等前来谒见的大和众得知，为了表达反对抗争之意，竟然连夜不告而别。一个是大和兴福寺一乘院出身的新任将军，一个是大和兴福寺寺兵出身的守护继任者，兴福寺这个嘴巴打得可是够重的。这是第一个拒绝执行新任将军命令的近畿地方势力。
第三个嘴巴就是织田信长打的了。不知是不是刚刚当上将军，晕了头脑。足利义昭竟然没有询问织田信长的意见，就下令织田信长继承三管领之一斯波家的家格。可能按照义昭的逻辑，这是好意，因为室町幕府历代尾张守护都是由斯波家继承。而且继承了斯波家，就可以成为副将军，控制幕府政治的全面行使。足利义昭觉得自己这招很聪明，却不想织田信长根本就不上钩。
足利义昭的小把戏织田信长看得清清楚楚，当宣下在格式上把柴田胜家和佐久间信盛与自己并列时，就开始警醒了。就连柴田胜家和佐久间信盛都看出问题，连夜过去告罪，并要辞掉官职。还是信长觉得不应驳了新任将军的面子，让两人接受下来。没想到这个笨蛋将军，不知是哪些蠢货给他出的蠢主意，竟然变本加厉起来。
如果接受将军任命，成为斯波家家主，首先就把篡主家之位的名头坐稳了，况且还要把织田家家主之位让出。为了一个好听的名义出让实权，分散实力，新任弹正忠殿下怎会做这样的傻事。再说，足利义昭不是先下令织田信长成为三管领之一和副将军，而是先下令建立政所，并任命了执事和执事代。这就如后世的‘党国’还是‘国党’，谁在前谁在后，区别可是很大的。用一个没有实权的副将军就想把自己摆在前台，为他火中取栗，摆平近畿的一切麻烦。只能说想法是美好的，现实是无奈的。
现实就是织田信长只接受了和泉国守护一职，并正式接管堺。斯波家家主，管领，副将军神马的都是浮云，统统以资历不够为借口拒绝掉。
这样，二十日的将军令，就非常别扭的发布了以下几条：
第一，和泉守护织田信长，同时委托堺的一切权利；
第二，河内守护三好义继（若江城），畠山高政（高屋城）；
第三，大和支配松永久秀（多闻山城）；
第四，摄津守护和田惟政（
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