关于刘伯温之死，刘伯温病重后，因为接受了胡惟庸派来的医生的治疗，然后就死了，而人们通常怀疑刘伯温其实是死于朱元璋之手。他其实是死于胡惟庸的暗算，当时担任宰相的胡惟庸嫉恨刘伯温，因此指使人向朱元璋进谗言陷害刘伯温，朱元璋自然很生气，夺了刘伯温的爵位。在胡惟庸势力的压制下，心情郁闷的刘伯温终于病了，然后就发生了胡惟庸派医生来为他看病刘伯温病逝的事。
当时朱元璋他绝没有杀死刘伯温的想法，一来那时刚建国七年，身体很健康的朱元璋就算想杀功臣也不用这么早就动手；二来年纪比朱元璋大十七岁的高级军师刘伯温在朝中也远没有淮西集团势力大，对朱元璋远构不成威胁；朱元璋当时也只是想在以李善长、胡惟庸为首的淮西集团和以刘伯温为首的浙东集团之间搞权力平衡而已。
朱元璋在李善长退休之后曾经邀请刘伯温出任丞相，可是刘伯温一再地谢绝了，他不想介入到朝廷派系斗争的漩涡中，他忌惮于功高震主，早就抱定了功成身退的主意。朱元璋也知道刘伯温的心思，也就不好再勉强，他转而向刘伯温咨询包括胡惟庸在内的丞相人选。刘伯温的回答是，这几个人都不成。
但朱元璋最终还是任用胡惟庸担任了丞相，他似乎另有他的谋划。可是让朱元璋万万没有想到的是，胡惟庸竟然胆大妄为地害死了刘伯温。
被朱元璋以逾制理由杀死的廖永忠，人们认为他真正的死因乃是他当初执行了谋杀小明王的任务。
在皇权至大至威的封建社会，臣子私穿绣有龙凤图案的衣服，论起罪来，恐怕都是要判斩立决的，按明朝的法律来论自然也不例外。朱元璋执法的严格，他是一位古今中外都少见的六亲不认的严格执法者，朱元璋连至亲戚犯法都绝不宽恕，开国功臣、亲侄子朱文正违法乱纪，乃按律囚禁；驸马爷走私捞钱，被发现后，也被按律处死。
廖永忠的死其实就并不冤了，朱元璋对廖永忠的处置并没有超过法律的规定。但若把廖永忠之死联系到小明王之死，说朱元璋借故杀功臣也未尝不可。
小明王的死因是什么？朱元璋的江山始终是靠自己打下来的，虽然从郭子兴统军时起朱元璋是小明王、刘福通名义上的部下，但实质上双方其实只是一种农民起义军之间的同盟关系。乱世间，群雄逐鹿，哪一方不都是在为自己打天下吗？当小明王的力量损失殆尽了，朱元璋出于道义把小明王救出并供奉了几年，当天下将定时，任何人处在朱元璋的位置上，难道谁还真的会把自己打下的江山拱手让给不太相干的他人吗？
明朝开国，文臣武将可说是如群星般的灿烂。但这些人中，有许多在连年的战争中牺牲了，也有不少是在战争年代或建国后的和平年代中因病而死或正常老殁了，还有一些，则有因犯法而死的，有因涉嫌谋反而死或因此连坐而死的。
常遇春，因病死于北伐途中。李文忠，建国后病死。朱文正，因违法被囚禁，病死于监狱。邓愈，建国前病死。胡大海，建国前死于降将的暗算。朱亮祖，建国后犯法而死。周德兴，以儿子乱法连坐而死。傅友德，因请赏田被朱元璋赐死。冯国用，死于军中。冯胜，连坐蓝玉案赐死。沐英，世代镇守云南。康茂才，病死军中。郭英，老病而终。叶琛，被叛军捕获，不屈而死。章溢，病死。
一般认为傅友德、冯胜两人是朱元璋为了让皇孙的帝位不受任何可能的威胁而找借口处死的。这两位功臣确实是被冤枉了，朱元璋找借口杀功臣并非全属编造，而是确有其事。
真正使朱元璋得杀功臣恶名的主要是发生于胡惟庸谋反案和蓝玉党案，朱元璋借这两件大案以连坐之法各屠杀了三万人和一万五千人。在封建社会，历朝历代，谋反、结党通常是皇帝忌恨极大的罪行，惩处起来通常是无所不用其极，包括酷刑、连坐在内。
胡惟庸，早年追随朱元璋起兵，颇受宠信，先后担任元帅府奏差、知县、通判等多种低、中级官职，在开国功臣中几乎排不上名。也就是说，朱元璋打天下的过程中，胡惟庸的建树非常小，因为追随了朱元璋，他才在乱世中混了口饭吃。
胡惟庸的发迹主要是在建国以后，洪武三年，胡被任命为中书省参知政事，洪武六年，又被任命为右丞相，洪武十年，胡惟庸甚至当上了位居百官之首的左丞相。胡惟庸在打天下的过程中并未立有大功，但因为是李善长的亲信，同时也受到朱元璋的信任，所以升官很快，可说是权力平衡斗争中的受益者。
最初只是朱元璋帐下文书的淮西人胡惟庸，之所以被朱元璋提拔上来委以重任，其实只是朱元璋想利用来制衡朝廷中权势最大的淮西派首领李善长的一颗棋子，可是胡惟庸在当上宰相的头几年里，一方面既得朱元璋宠信，另一方面又紧紧倚靠着李善长，这使得朱元璋很不舒服，而胡惟庸本身的问题又那么多。
胡惟庸眼见自己权势日大，就日益地骄横跋扈起来，专权擅决、受贿营私，结党自固、试图谋反以及勾结日本、蒙古，所以朱元璋干脆就把他这一支野心勃勃且日益壮大的力量彻底给废了。
之后一不做二不休，为子孙算计，为社稷的朱元璋又干脆那李善长这棵盘根错节的大树给拔除了。至此，朱元璋终于决定把在内心深
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