李世民征求秦王府幕僚们的意见，大家都说:"齐王凶恶乖张，是终究不愿意事奉自己的兄长的。近来听说护军薛实曾经对齐王说:大王的名字，合起来可以成为一个唐字，大王终究是要主宰大唐社稷。齐王欢喜地说:只要能够除去秦王，夺取东宫太子之位就易如反掌了。他与太子谋划作乱还没有成功，就已经有了夺取太子之位的心思。作乱的心思没有满足，又有什么事情做不出来呢!假使这两个人如愿以偿了，恐怕天下就不再归大唐所有。以大王的贤能，捉拿这两个人就如拾取地上的草芥一般容易，怎么能够为了信守匹夫的节操，而忘了国家社稷的大事呢!"
李世民仍然没有决断，大家又问道:"大王认为舜是什么样的人呢?"李世民答道:"是圣人。"大家说:"假如舜帝在疏通水井的时候没有躲过父亲与弟弟在上面填土的毒手，便化为井中的泥土了;假如他在涂饰粮仓的时候没有逃过父亲和弟弟在下面放火的毒手，便化为粮仓上的灰烬了，怎么还能够让自己恩泽遍及天下，法度流传后世呢!所以，舜帝在遭到父亲用小棒笞打的时候便忍受了，而在遭到大棍笞打的时候便逃走了，这大概是因为舜帝心里所想的是大事啊。"
这时阎立言奉轩辕经天之命前来占卜。阎立言口不能言，然而算无遗策，特意为李世民算卦。天地交泰，上卦。
轩辕经天又连续几晚托梦。
李世民命令长孙无忌秘密地将房玄龄等人召回，房玄龄等人不答应回秦王府，说道:"陛下敕书的旨意是不允许我们再事奉大王的。如果我们现在私下去谒见大王，肯定要因此获罪而死，因此我们不敢接受大王的教令!"
李世民发怒，对尉迟恭说:"房玄龄、杜如晦难道要背叛我吗!"
他摘下佩刀交给尉迟恭道:"明公前去察看一下情况，如果他们果真没有回来的意思，可砍下他们头回来见我。"
尉迟恭前去，与长孙无忌一起明示房玄龄等人说:"大王已经将行动的计划决定下来了，众位明公应该速去秦王府中共议大事。我们四个人不能在街道上同行。"于是命令房玄龄和杜如晦穿上道士的服装，与长孙无忌一同进入秦王府，尉迟恭则经由别的道路也来到了秦王府。
六月初三己未日(626年7月1日)，太白金星再次在白天出现在天空正南方的午位。
轩辕经天再次托梦。
傅奕秘密上奏道:"金星出现在秦地的分野上，这是秦王应当拥有天下的征兆。"高祖将傅奕的密奏给秦王世民看。
于是这样，李世民乘机秘密上奏父皇，告发李建成和李元吉与后宫的嫔妃yín_luàn，而且说:"儿臣丝毫没有对不起皇兄和皇弟，现在他们却打算杀死儿臣，这简直就像要替王世充和窦建德报仇。如今我快要含冤而死，永远地离开父皇，魂魄归于黄泉，如果见到王世充诸贼，实在感到羞耻!"高祖望着李世民，惊讶不已，回答道:"明天朕就审问此事，你应该及早前来参见朕。"
张婕妤暗中得知了李世民密奏的大意，急忙告诉李建成。李建成将李元吉召来商议此事，李元吉说:"我们应当管好东宫和齐王府中的士兵，托称有病不去上朝，以便观察形势。"李建成道:"宫中的军队防备已很严密了，我与皇弟应当入朝参见，亲自打听消息。"于是二人决定先入大内皇宫逼高祖表态。不料在宫城北门玄武门执行禁卫总领常何本是太子亲信，却被李世民策反，因此宫中卫队已经倒向秦王，李建成和李元吉却不知道，还以为宫中都还是自己人。
武德九年六月初四庚申日(626年7月2日)，李世民率领长孙无忌、尉迟恭、侯君集、张公谨、刘师立、公孙武达、独孤彦云、杜君绰、郑仁泰、李孟尝(一说为长孙无忌、尉迟恭、房玄龄、杜如晦、宇文士及、高士廉、侯君集、程知节、秦琼、段志玄、屈突通、张士贵)等人入朝，并在玄武门埋下伏兵。李建成、李元吉二人不知底细，也一起入朝，骑马奔向玄武门。此时，高祖已经将裴寂、萧瑀、陈叔达、封德彝、裴矩等人召集前来，准备查验这件事情了。
李建成、李元吉来到临湖殿，察觉到了变化，立即掉转马头，准备向东返回东宫和齐王府。
几人见面，李元吉想先下手为强，张弓搭箭射向李世民，但由于轩辕经天在暗中保护，为李世民设置了人皇防御法阵，箭没有射中。
李世民经过轩辕经天神识提醒，立刻搭弓射向李建成，将他射死了。
尉迟恭带领大成真人七十人相继赶到。
一名大成真人用箭射中了李元吉，李元吉跌下马来。
可就在此时，李世民的坐骑受到了惊吓，带着李世民奔入玄武门旁边的树林，李世民又被林中的树枝挂住，从马上摔下，倒在地上，一时爬不起来。
李元吉迅速赶到，夺过弓来，准备勒死李世民，幸好李世民有人皇防御法阵保护。而且就在这时尉迟恭跃马奔来大声喝住了他。李元吉知道不是对手，赶紧放开李世民，想快步跑入武德殿寻求父皇庇护，但尉迟恭快马追上他，放箭将他射死了。
太子李建成的部下、翊卫车骑将军冯立得知建成身死，叹息道
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