次日一早，浩罕城外，上万的讨虏军和锡克骑兵便展开了攻城。火炮已经停止，城东的城墙已经有两道巨大的缺口，城内的守军正在组织民夫垒塞，不过显然已经来不及了。
上千名锡克骑兵形成两束尖锥阵型，一马当先直插两个城墙破口，城墙缺口处顿时响起一片杀喊声，数百骑兵堵塞在那里。但随着后续骑兵的不断加入，城内的浩罕士兵抵挡不住，先前的锡克骑兵很快清理出一条通道来，后面源源不断的锡克骑兵前赴后继，猛冲而入。不一会儿，城东门便吱吱呀呀地打开了。
紧随其后的讨虏军士兵蜂拥而入，霎时，浩罕城便正式告破。城内的浩罕兵虽然有部分仍旧悍不畏死，组织反扑，但在队列整齐的火枪射击下，很快便倒入血泊之中。而这时，不知道谁透露出浩罕可汗已经逃走的消息，顿时，所有浩罕兵都失去了反抗的理由，不是投降便是逃入民宅中躲藏起来。浩罕城很快便被讨虏军占领。
中午不到，义王石达开在罗琼树、石祥祯等将领的陪同下，骑着高头大马径直来到浩罕城已经有些坍塌的东城门口。石达开注意到，阿克谢领着百余名锡克骑兵押着数名俘虏候在一旁，便随口问了句，没想到被告知，那几名俘虏中为首者，竟然是昨夜逃走的浩罕可汗阿力木库尔。原来，昨夜阿力木库尔率领二千浩罕骑兵从城西仓惶逃走，锡克探哨发现后，阿克谢一边通知石祥祯派人堵截，一边亲自领着二千锡克骑追击，一夜激战杀得浩罕骑兵四散逃走，最终在早上将躲藏在一处小山谷里的阿力木库尔和几名浩罕贵族俘虏，刚刚押送回来。
看着脸色惨白的阿力木库尔，石达开没有丝毫同情，直接下令道：“来人呐，将这侵略中华帝国的首恶斩首示众三日，再将其首级置于攻占塔什干的军中大旗上，震慑敌兵，促其献城！”
顿时，罗琼树抽刀上前，手起刀落，将还在求饶不已的阿力木库尔斩为两段，如此果决，让在场的锡克骑兵也心惊不已。阿克谢更是暗自提醒自己谨慎，要约束部下，免得犯了义王忌讳。这几天的激战，虽然他的锡克骑兵团英勇异常，但实际杀敌，却远不如对方那一排排火枪步兵来得干脆和举重若轻，而伤亡比例更是少得吓人，而且，这还是对方有意压制的结果。阿克谢便清楚，就算不是浩罕兵，换了自己的锡克骑兵，正面作战，只怕一样的惨败。也许，回去之后要向大君建议，锡克要加强火枪兵的组建才行了。
石达开派石祥祯率领数千步兵马队会同二千锡克骑兵乘胜扩大战果，进攻塔什干城，其余的将士，在浩罕城内休整了三日。
被俘浩罕士兵，石达开选出四千人将之全部交给锡克骑兵团，作为战俘押回旁遮普充当奴隶，其余的三千俘虏连同城内的二千名强壮青壮，全部让一个步兵团押解到喀什噶尔和叶尔羌等地，作为战俘劳力去开垦荒地，交付地方驻兵管理。
至于城内其余的浩罕平民，石达开没有过多为难，只是通告众人安心下来，如同往常一样生活，又挑选了几名从喀什噶尔城带来的向导和亲近华夏的浩罕商人作为临时官员，协助管理浩罕城内的民政之事。浩罕汉国出来塔什干等地外，基本已被中华帝国吞并下来，不过如何治理，还是个麻烦的事情。毕竟，如今也就伊犁一带勉强有梁立泰作为新疆总督，设立了总督府，招揽了一帮幕僚和属官进行治理地方，就连喀什噶尔和和阗等地都还只是派遣几名地方主官刚刚组建地方官府，更别说哪有官员派来主政这新占的浩罕汗国了。但石达开也没有什么好办法，他只能派遣信使禀报皇帝，同时转抄梁立泰，让对方安排人员前来交接。
第七日，消息传来，塔什干城的守将在石祥祯部还未抵达，便领兵西逃布哈拉汗国。自此，整个浩罕汗国国土全部被占，浩罕汗国就此灭亡。
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