有了李鸿章的支持，光绪十二年二月，宋骁飞被光绪皇帝任命为从一品的北洋提督，他一上任，马上宣布了北洋水师的人事调整：聘用英国海军少校琅威理和美国顾问马吉芬为实职副提督，但琅威理的薪水为3600美元，约合四百两白银，马吉芬的年薪为2400美元，约合三百余两，以示对琅威理更重视，但两人权力一样。另外，将北洋水师右翼总兵刘步蟾指定为北洋水师提督的接班人，这对刘步蟾来说，也相当于“升官”，因为按照北洋水师的章程，左翼总兵的地位应该比右翼总兵要高。因为丁汝昌又从德国带回了两艘远洋铁甲舰，宋骁飞增加了北洋水师中翼，把左翼副总兵邓世昌提拔为北洋水师中翼总兵。至于左翼总兵林泰曾，宋骁飞见他果然英勇骁战，给他的左翼舰队多划拨了一艘铁甲军舰，还把北洋水师仅有的两艘七千吨级别的铁甲巨舰中的“镇远”号交给他管带。这样一来，五人对宋骁飞都比较满意。
宋骁飞了解到，当时世界海军装备曰新月异，军舰的主机、锅炉、火炮、装甲，种种技术都在迅速更新，“速度重于装甲度”、“射速重于火炮口径”的观念已逐渐占主流地位，于是把北洋陆军学堂第三年的办学经费先挪用，拨出十万两银子，为十五艘军舰更换了蒸汽锅炉，另花八十万两银子为军舰添购了四十门克虏伯快炮，另外，特别注重检查炮弹质量，全部选购威力最大的开花弹。
经过这一番人事调整和装备弹药升级，加上宋骁飞有海战经验，是李鸿章的心腹，他很快树立自己在北洋水师中的威信，宋骁飞下令北洋水师抓紧时间按照琅威理制定的英国海军章程艹练，训练一字纵队、鱼鳞队等阵法，演练打靶、演放水雷，积极备战，因为他的下一步目标将是：收回琉球！;
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